HTS Datenanalyse - quattro/Workflow
High-Throughput-Screening (HTS) ist eine der Schlüsseltechnologien um vielversprechende biologisch-aktive Moleküle in der Medikamentenforschung zu identifizieren. Der zunehmende Automatisierungsgrad im Labor und in der Assay-Entwicklung ermöglicht es dem Wissenschaftler jeden Tag tausende von Datensätzen zu generieren.
Die manuelle Auswertung dieser Datensätze ist sehr aufwendig. Durch die Vielzahl der notwendigen Arbeitsschritte ist die Auswertung fehleranfällig, was zu Problemen mit der Reproduzierbarkeit und der Validierung führen kann.
Die Anwenderfreundlichkeit und Praxisnähe von quattro/Workflow wird durch die enge Zusammenarbeit zwischen einem führenden Anbieter von Screening-Dienstleistungen und quattro research gewährleistet.
Vorteile
- Integrierte Workflow Engine zur Abbildung komplexer Auswertungsmethoden
- Sehr schnell: Bearbeitung von mehr als 1000 Wellplatten in wenigen Minuten
- Unterstützt 96, 384 und kundenspezifische Wellplattenformate
- Robuste integrierte Kurvenanpassungsalgorithmen, z.B. zur IC50 Berechnung
- Visuelle Analyse von Multi-Wellplatten um Trends, Auffälligkeiten etc. zu erkennen
- Template-basierender Import von Rohdaten; unterstützt beliebige Text- oder MS Excel-Formate
- Umfassende Chemieunterstützung
- Offenes XML-Datenformat
- Kostenloses Programm zum Betrachten der Ergebnisse, erlaubt Zugriff mehrerer Anwender auf einen Datensatz
- Einfache Installation, keine Datenbank und kein Server notwendig
- Optional: Oracle Schnittstelle für die Integration in bestehende Infrastruktur
Workflow
Die Flexibilität von quattro/Workflow erlaubt die automatische Analyse von fast allen HTS Daten. Je nach Ursprung der Originaldaten erhält der Benutzer detaillierte Reports mit allen relevanten Informationen, z.B. IC50, Z?, CV etc.
Initiales Screening
quattro/Workflow kann tausende Racks innerhalb von wenigen Minuten analysieren und visualisieren.
Interaktive Wellplatten Ansichten helfen bei der schnellen Identifikation von falsch-positiven Datensätzen.
In einer Stapelansicht lassen sich hierzu beliebig viele Wellplatten in einer Grafik überlagert darstellen.
Qualitätsmanagement
quattro/Workflow berechnet automatisch verschiedene statistische Parameter, z.B. Z?, CV etc. Interaktive Grafiken erlauben einen Einblick in problematische Datensätze und helfen Trends frühzeitig zu erkennen.
Dosis-Wirkungs Analyse
Bei Dosis-Wirkungs-Experimenten wertet quattro/Workflow die Daten mit Hilfe einer nicht-linearen Regression aus. Der Plausibilitätscheck reduziert die manuelle Nacharbeit auf ein Minimum. Ausreißer-Werte können manuell entfernt werden. Alle Änderungen der Daten werden in der Ergebnisdatei dokumentiert.
Chemie-Modul
quattro/Workflow ermöglicht die Kombination von Ergebnissen, z.B. aus Dosis-Wirkungs-Experimente mit chemischen Strukturen. Das Chemie-Modul integriert Daten von SD-Files, Oracle Datenbanken oder anderen kundenspezifischen Datenquellen.